Le gouvernement général de l'Institut est formé du Frère Supérieur Général, des membres de son Conseil et des services généraux de la Congrégation

Le frère Supérieur général et les trois frères Assistants sont élus par le Chapitre général. La Congrégation a tenu son dernier Chapitre général à Rome du 1er au 23 mars 2006. À cette occasion, le Conseil général a été totalement renouvelé.

Les Frères du Conseil général, élus au chapitre de l'an 2006

Le Supérieur général veille à promouvoir l'unité de la Congrégation, la vitalité religieuse des Frères et leur fidélité à l'esprit des Fondateurs et à la mission de l'Institut ainsi qu'aux orientations des Chapitres généraux..

Les frères Assistants l'aident à élaborer la politique de l'Institut par leur réflexion et la qualité de leur discernement. En dehors de leurs visites dans les Provinces de la Congrégation, les membres du Conseil résideront désormais à Rome, ce qui pourra rendre plus fréquentes les réunions du Conseil, jusqu'ici regroupées en trois sessions annuelles.

Le dernier Chapitre général a redéfini le rôle et la fonction du frère Assistant. Ils demeurent les Conseillers du frère Supérieur général dans le gouvernement de la Congrégation et donnent leurs avis sur les questions abordées au Conseil. Mais il ne sont plus chargés particulièrement d'un secteur géographique ou linguistique de la Congrégation, même s'ils peuvent recevoir un mandat particulier du frère Supérieur général pour accompagner telle ou telle province. Ils seront chargés de l'animation de la Congrégation sur des dossiers confiés à leurs soins, surtout dans les domaines du charisme et de la mission partagée, des vocations et de la formation.